به گزارش اسپوتنیک به نقل از تسنیم، ابراهیم رئیسی، رئیس قوه قضائیه ایران درگذشت معاون قضایی قوه قضائیه را طی پیامی تسلیت گفت، در این پیام آمده است: "درگذشت همکار محترم جناب حجت الاسلام و‌المسلمین حاج شیخ علی خلفی معاون قضایی قوه قضاییه که پس از تحمل یک دوره نسبتا طولانی بیماری و نقاهت سرانجام دعوت حق را اجابت نمود موجب تالم و تاثر شدید اینجانب و همه دوستان و آشنایان ایشان در قوه قضاییه شد."
غلامحسین محسنی اژه‌ای، معاون اول قوه قضائیه نیز در پیامی جداگانه درگذشت معاون قضایی قوه قضائیه را تسلیت گفته است. خلفی در دوره ریاست صادق آملی لاریجانی بر قوه قضائیه، به مدت 10 سال رئیس حوزه ریاست قوه قضائیه بود.